文化庁メディア芸術祭アニメーション部門大賞など数々の映画賞に輝いた、傑作「クレヨンしんちゃん 嵐を呼ぶアッパレ！戦国大合戦」（2002年）が実写映画として蘇る。監督はあの「ALWAYS 三丁目の夕日」で日本全国を温かい涙で包んだ山崎貴。さらに、“鬼の井尻”と呼ばれた主人公の戦国武将を草なぎ 剛、小国の美しき姫・廉姫を今最も輝いている女優・新垣結衣が演じる。そんな彼らの描く、時代を超えた荘厳な涙の物語が今始まる…！

　　時は戦国時代…。春日という小国に、“鬼の井尻”と恐れられる無敵を誇る、井尻又兵衛という侍がいた。ある戦の日、一瞬の隙から命を奪われそうになった又兵衛を、未来からタイムスリップしてきたという不思議な少年、川上真一が救う。城主・康綱の命令で真一の面倒を見ることになった又兵衛。二人の間には、次第に奇妙な絆が生まれるようになる。
　一方、真一やその家族の登場で、一度受け入れられた康綱の娘・廉姫との縁談を断られた北関東の大名・大倉井高虎は、破談に激怒し春日の国に大軍を送り込んでくる。互いに身分違いの恋心を抱く又兵衛と廉姫、さらに真一たちの運命は…！